Jesienią 2000 roku, podczas Salonu Samochodowego w Paryżu, debiutowała druga generacja samochodów Laguna. Atrakcyjna forma zewnętrzna i szereg nowatorskich rozwiązań technicznych zyskały uznanie zarówno fachowców jak i nabywców. Na rynek, w styczniu 2001 roku, wprowadzono równocześnie dwie wersje nadwoziowe. Rozstaw osi zwiększono o 7,5 cm. Pięciodrzwiowy hatch-back miał charakter eleganckiego pojazdu rodzinnego natomiast model z nadwoziem kombi (o nazwie Break, Estate lub Grandtour) był bardziej dynamicznie ukształtowany niż poprzednik. Odpowiednia konstrukcja struktury nadwozia i jego bogate wyposażenie w zakresie bezpieczeństwa, spowodowały uzyskanie najwyższej oceny w testach zderzeniowych organizacji EuroNCAP. Był to pierwszy pojazd, który uzyskał ocenę w postaci 5 gwiazdek.

Do ciekawszych rozwiązań zastosowanych w tym modelu należały karta z chipem, zastępująca tradycyjny kluczyk oraz system kontroli ciśnienia powietrza w każdym kole.

Początkowo gama jednostek napędowych składała się z trzech silników benzynowych o pojemności skokowej 1,6, 1,8 i 3,0 dm³ oraz dwóch turbodoładowanych silników Diesla o pojemności 1,9 dm³. Kilka miesięcy później gamę powiększono o benzynowy silnik o pojemności 2,0 dm³ wyposażony w bezpośredni wtrysk paliwa (IDE) i trzecią wersję turbodiesla 1,9 dm³. W styczniu 2002 roku przybył nowy silnik Diesla o pojemności 2,2 dm³.

W następnym roku gamę silników benzynowych powiększono o turbodoładowaną jednostkę napędową o pojemności 2,0 dm³.

W kwietniu 2005 roku zmodernizowano rodzinę samochodów Laguna (Phase2). Operacja face-lifting wpłynęła na zmiany kształtu przedniej i tylnej części nadwozia. Pojawiła się wówczas także nowa wersja Laguny oznaczona literami GT

Istotne zmiany nastąpiły także w zespołach napędowych. Wycofano benzynowy silnik o pojemności 1,8 dm³, ale wzmocniono silnik 1,6 dm³. Turbodoładowany silnik 2,0 dm³ oferowano w dwóch wersjach. Zmodernizowano także turbodoładowane silniki Diesla o pojemności 1,9 dm³, a końcem tegoż roku wprowadzono dwa nowe silniki o pojemności 2,0 dm³.

Zakończenie produkcji pojazdów drugiej generacji nastąpiło w 2007 roku.